Pracovné skupiny sú vytvorené na základe profesionálneho záujmu, zasadajú osobitne a venujú sa špecifickým témam. Každá z deviatich pracovných skupín zasadá počas roka minimálne štyri krát a 75% zo všetkých týchto zasadaní sa uskutoční v priamo regiónoch. Prácu a hlasovanie v pracovných skupinách vedú dvaja spolupredsedovia, pričom jeden reprezentuje štátny sektor (zástupca relevantného ministerstva, príp. štátneho úradu) a druhý je zástupcom neštátneho sektora (súkromného sektora, samosprávy, mimovládneho sektora, akademickej obce a pod.).
